В рамках своей деятельности Комиссия сотрудничает с Деловым Советом Россия – Монголия при ТПП России, с Обществом Российско-Монгольской дружбы, с Первым Департаментом Азии МИД России и Посольством Монголии в России, с Департаментом Азии и Африки Минэкономразвития России, а также с Центром Международного Промышленного Сотрудничества ЮНИДО в Российской Федерации.
В октябре 2013 года заключено Соглашение о сотрудничестве между МТПП и Национальной торгово-промышленной палатой Монголии. Комиссия способствовала подписанию «Меморандума о взаимопонимании» между представителями Гильдии организаций энергетического комплекса МТПП и Министерством Энергетики Монголии. Прорабатывается вопрос с Министерством культуры, спорта и туризма об участии представителей Гильдии организаций энергетического комплекса МТПП в строительстве спортивных сооружений Монголии.
В апреле 2013 года организован прием Деловой мисси предпринимателей Монголии и проведен Круглый стол по теме: «Актуальные проблемы российско-монгольского торгово-экономического сотрудничества». Участники встречи ознакомились с Перечнем приоритетных проектов Правительства Монголии на период 2012 – 2016 годы и установили прямые контакты в различных сферах деятельности. Готовится ответный визит членов МТПП в Монголию.